La microbiota intestinal es un ecosistema de varios cientos de especies microbianas (bacterias, levaduras, etc.) que se va formando gradualmente tras el nacimiento en animales y humanos. Si la composición de la microbiota intestinal es específica de cada individuo, estudios recientes en humanos y animales han demostrado que la variedad de microbiota observada dentro de una población puede agruparse en grandes categorías que presentan características similares en términos de grupos bacterianos representados. A menudo se considera que el entorno, en particular el entorno materno al nacer, y la dieta son los principales factores que influyen en la composición de la microbiota de los jóvenes. Por otro lado, la importancia de los factores genéticos del huésped en su microbiota todavía es objeto de debate porque está mal evaluada. Por primera vez seleccionado un equipo del INRAE 2 líneas de cerdos cuyos padres fueron elegidos según 2 tipos de microbiota intestinal. De este modo, los científicos estudiaron la influencia de factores genéticos en la formación de la microbiota intestinal de 1.000 cerdos a lo largo de tres generaciones.
Líneas de cerdos seleccionadas por su microbiota intestinal
Para evaluar si es posible seleccionar cerdos según la composición de su microbiota intestinal, los científicos demostraron en primer lugar que es posible dividir lechones de 60 días en 2 grupos correspondientes a 2 tipos de microbiota llamados enterotipos. Cada enterotipo se caracteriza por una relativa sobreabundancia de 2 géneros bacterianos: Prevotella y con mitsuoke para el enterotipo PM, y Ruminococo y Treponema para enterotipo RT. Para el establecimiento de las 2 líneas seleccionadas, los reproductores fueron elegidos con base en un análisis de heces, para retener aquellas que presentaban una microbiota tipo PM o RT. Luego los lechones de las 2 líneas fueron criados exactamente en las mismas condiciones (mismo lugar, misma comida).
Los resultados muestran que en la línea seleccionada para el enterotipo PM, la frecuencia de este enterotipo aumentó del 53% en la población inicial antes de la selección al 87% después de 3 generaciones; en el otro linaje, la frecuencia del enterotipo RT aumentó del 47% al 70%. Los análisis de la velocidad de crecimiento de las 2 líneas muestran que los cerdos seleccionados con la microbiota tipo PM tienen un crecimiento más rápido hasta los 70 días de edad. Un análisis más detallado reveló que los 2 enterotipos contienen bacterias con diferentes actividades metabólicas. El enterotipo PM es notablemente más rico en genes bacterianos capaces de degradar el almidón, metabolizar azúcares y sintetizar importantes aminoácidos. Gracias a estas 2 líneas de cerdos se seguirá trabajando en el estudio de la estabilidad de los enterotipos durante la vida de los animales y su influencia en la producción, salud y comportamiento de los cerdos.
Estos resultados demuestran que la genética del animal tiene una influencia significativa en la formación de su microbiota intestinal y que su composición no depende sólo del entorno. Confirman el interés de tener en cuenta la microbiota intestinal en los esquemas de selección para mejorar la sostenibilidad y la resiliencia en la cría.
